Евгений Иванович Шапошников родился в Ростовской области 3 февраля 1942 года.
В 1963 году, после окончания Харьковского высшего военно-авиационного училища, начал службу в Прикарпатском военном округе.
В 1966-1969 годах учился в Военно-воздушной академии им. Ю.А. Гагарина.
В 1971-1987 годах Евгений Иванович прошел путь от заместителя командира полка по политической части до командующего военно-воздушными силами военного округа (он служил в Прикарпатье, Одессе и в Германии).
В 1990 году Шапошников стал заместителем Министра обороны СССР и Главнокомандующим военно-воздушными силами. После провала августовского путча 1991 года, когда он не поддержал выступление ГКЧП, Шапошников стал последним Министром обороны Советского Союза. Находясь на этом посту, способствовал департизизации армии, упразднению политорганов.После распада СССР Шапошников продолжил свою карьеру в независимой России, став главнокомандующим Объединенными Вооруженными Силами СНГ.
В 1993 году он получил назначение на пост Секретаря Совета Безопасности России.После ухода в отставку в 1994 году Евгений Иванович стал представителем Президента России в «Росвооружении» , государственной компании, занимающейся экспортом и импортом вооружения и военной техники.
В 1995-1997 годах Шапошников занимал должность генерального директора авиакомпании «Аэрофлот – российские международные авиалинии» , а затем являлся помощником Президента России, в его ведении находились вопросы развития космоса и авиации.
В настоящее время Евгений Иванович является советником Генерального директора «ОКБ Сухого» , Президентом Партнерства «Безопасность полетов» , членом Попечительского совета Международного фонда экономических и социальных реформ.Заслуженный военный летчик России Евгений Шапошников награжден орденами Почета, Красной Звезды, «За службу Родине в Вооружённых Силах СССР» II и III степени и медалями, удостоен международного общественного ордена «Золотой Сокол» за вклад в достижение согласия и дружбы между народами, улучшение социальной и экономической жизни. Живет и работает в Москве.