Магомет Гербеков родился в 1923 году в ауле Старая Джетуга (ныне — Карачаево-Черкесия).
С 1933 года вместе с семьёй проживал в станице Преградной Урупского района. Окончив школу, работал в колхозе.
В июне 1942 года Гербеков был призван на службу в Рабоче-крестьянскую Красную Армию.
С того же года — на фронтах Великой Отечественной войны. Принимал участие в боях на Юго-Западном, Сталинградском и 2-м Украинском фронтах.Участвовал в Сталинградской битве, будучи наводчиком 82-миллиметрового миномёта 177-го отдельного пулемётного батальона 57-й армии.
В ноябре-декабре 1942 года Гербеков лично уничтожил вражеский пулемёт с расчётом, 2 блиндажа, 4 повозки и около 20 солдат и офицеров.
В дальнейшем стал командиром расчёта.
В ночь с 21 на 22 марта 1944 года участвовал в форсировании Южного Буга, уничтожив несколько вражеских пулемётных гнёзд. Во время форсирования Тисы 22 октября 1944 года Гербеков участвовал в отражении ряда вражеских контратак. Неоднократно отличался в боях за Будапешт и Австрию.
В 1946 году в звании старшины Гербеков был демобилизован и был вынужден уехать в Киргизскую ССР.
В 1973 году вернулся на родину. Умер в 1992 году.Указом Президента Российской Федерации от 7 сентября 1995 года за «мужество и героизм, проявленные в боях с немецко-фашистскими захватчиками в годы Великой Отечественной войны 1941—1945 годов» старшина Магомет Гербеков посмертно был удостоен высокого звания Героя Российской Федерации.