Родился 20 февраля 1950 года в Днепропетровске.
В 1972 году окончил архитектурный факультет Днепропетровского инженерно-строительный института.
В 1972—1986 годах — архитектор, главный архитектор проектов, руководитель архитектурной мастерской института «Киевпроект» .
С 1986 года главный архитектор, с 1993 года — директор Украинского государственного научно-исследовательского института проектирования городов «Дипромисто» .
В 2000 году защитил кандидатскую диссертцию на тему «Принципы планирования организации трансграничных территорий Украины» , а в 2003 году диссертацию на соискание ученой степени доктора архитектуры на тему «Эволюционные тенденции в теории и методологии регионального планирования» .Умер в 2009 году. Похоронен на Байковом кладбище.26 октября 2010 года распоряжением Кабинета Министров Украины имя Юрия Николаевича Белоконя было присвоено Украинскому государственному научно-исследовательскому институту проектирования городов «Дипромисто» .