Отто Ампферер являлся известным альпинистом конца XIX — начала XX века: в частности, он первым совершил восхождение на пик Guglia di Brenta (2872 м).
В период с 1935 по 1937 год Ампферер состоял в должности директора австрийской Геологической службы. Среди прочего он занимался геологическими исследованиям и картированием Тироля и Форарльберга.
В 1936 году он был избран членом академии Леопольдина.